Prediction of Protein-Protein Interaction Sites with Conditional Random Fields

Abstract

Anwendung der Mathematik, der Statistik\nund Informationstheorie auf dem Bereich der Molekularbiologie ist\nein etabliertes Gebiet der Naturwissenschaft. Viele Forschungen\nverwenden die statistischen Modelle mit Ansätzen der\nInformationstheoie zur Untersuchung und Analyse biologischer\nDatensätze. In diesem Projekt wird die\nProtein-Protein-Wechselwirkung fokussiert. Das Ziel ist die\nbedeutenden Stellen der Protein-Protein-Wechselwirkungen\nvorherzusagen, welche eine zentrale Rolle in vielen biologischen\nProzessen spielen. Die Methode basiert auf das so gennante\nConditional Random Field (CRF), welches zu stochastischen Modellen\ngehört. Darüber hinaus bezieht sich die Aufgabe auch auf\nmaschinelles Lernen, was ein wichtiger Punkt in der Anwendung\nist.